Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms