Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF3P61204 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF3P61204 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF3P61204 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF3P61204 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF3P61204 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF3P61204 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF3P61204 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF3P61204 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF3P61204 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF3P61204 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF3P61204 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF3P61204 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF3P61204 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF3P61204 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF3P61204 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF3P61204 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF3P61204 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF3P61204 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF3P61204 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF3P61204 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms