Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms