Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE2P56282 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE2P56282 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE2P56282 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE2P56282 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE2P56282 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE2P56282 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE2P56282 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE2P56282 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE2P56282 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE2P56282 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE2P56282 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE2P56282 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms