Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms