Protein–RNA interactions for Protein: P51858

HDGF, Hepatoma-derived growth factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFP51858 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFP51858 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFP51858 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HDGFP51858 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HDGFP51858 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFP51858 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFP51858 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFP51858 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFP51858 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFP51858 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFP51858 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFP51858 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFP51858 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFP51858 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFP51858 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFP51858 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFP51858 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFP51858 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFP51858 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFP51858 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFP51858 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFP51858 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFP51858 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFP51858 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFP51858 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFP51858 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFP51858 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFP51858 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFP51858 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFP51858 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms