Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms