Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NESP48681 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NESP48681 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NESP48681 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NESP48681 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NESP48681 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NESP48681 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NESP48681 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NESP48681 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NESP48681 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NESP48681 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NESP48681 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NESP48681 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NESP48681 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NESP48681 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NESP48681 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NESP48681 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NESP48681 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NESP48681 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NESP48681 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NESP48681 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NESP48681 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NESP48681 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NESP48681 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NESP48681 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NESP48681 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NESP48681 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NESP48681 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NESP48681 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NESP48681 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NESP48681 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NESP48681 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NESP48681 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NESP48681 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NESP48681 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NESP48681 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NESP48681 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NESP48681 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NESP48681 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NESP48681 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NESP48681 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NESP48681 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NESP48681 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms