Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
ATP5OP48047 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5OP48047 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms