Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms