Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC1A2P43004 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms