Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSG1P42857 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NSG1P42857 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NSG1P42857 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NSG1P42857 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NSG1P42857 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms