Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RORAP35398 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RORAP35398 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORAP35398 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORAP35398 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORAP35398 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORAP35398 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORAP35398 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORAP35398 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORAP35398 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORAP35398 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORAP35398 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORAP35398 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORAP35398 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RORAP35398 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RORAP35398 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms