Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OTX2P32243 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTX2P32243 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTX2P32243 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms