Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2E2P29084 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms