Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSX1P28360 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSX1P28360 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSX1P28360 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSX1P28360 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSX1P28360 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSX1P28360 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSX1P28360 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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MSX1P28360 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSX1P28360 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSX1P28360 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSX1P28360 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSX1P28360 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSX1P28360 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSX1P28360 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MSX1P28360 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSX1P28360 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSX1P28360 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSX1P28360 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSX1P28360 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSX1P28360 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSX1P28360 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSX1P28360 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MSX1P28360 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSX1P28360 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MSX1P28360 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSX1P28360 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSX1P28360 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSX1P28360 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSX1P28360 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSX1P28360 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSX1P28360 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MSX1P28360 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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MSX1P28360 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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MSX1P28360 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MSX1P28360 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MSX1P28360 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MSX1P28360 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MSX1P28360 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MSX1P28360 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MSX1P28360 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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MSX1P28360 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSX1P28360 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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