Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VARSP26640 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VARSP26640 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VARSP26640 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VARSP26640 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VARSP26640 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VARSP26640 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VARSP26640 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VARSP26640 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms