Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTNNA2P26232 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNA2P26232 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms