Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPREP23469 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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