Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB4P16144 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms