Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNT1P13805 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms