Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPFIA4O75335 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms