Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NPHP4O75161 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms