Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCA5O60264 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCA5O60264 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCA5O60264 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCA5O60264 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCA5O60264 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCA5O60264 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms