Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX3O43711 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX3O43711 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLX3O43711 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLX3O43711 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLX3O43711 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX3O43711 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms