Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DENRO43583 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
DENRO43583 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DENRO43583 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DENRO43583 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DENRO43583 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DENRO43583 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DENRO43583 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DENRO43583 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DENRO43583 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms