Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1GO43497 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1GO43497 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1GO43497 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1GO43497 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1GO43497 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1GO43497 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1GO43497 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1GO43497 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1GO43497 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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