Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP9YO00507 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP9YO00507 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP9YO00507 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms