Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCER2I3L3R5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCER2I3L3R5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms