Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms