Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DGG1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DGG1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DGG1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DGG1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DGG1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DGG1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DGG1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DGG1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DGG1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DGG1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DGG1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DGG1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DGG1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B4DGG1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
B4DGG1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms