Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IDSB3KWA1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms