Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN8

Uncharacterized protein ENSP00000372125, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NCN8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NCN8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NCN8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NCN8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NCN8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NCN8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NCN8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NCN8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A6NCN8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A6NCN8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NCN8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NCN8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NCN8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NCN8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NCN8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NCN8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NCN8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NCN8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NCN8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NCN8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NCN8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NCN8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A6NCN8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms