Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CPED1A4D0V7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms