Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
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