Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVW-1Q9UQF0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVW-1Q9UQF0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms