Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNM6

PSMD13, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD13Q9UNM6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMD13Q9UNM6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms