Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
L1RE1Q9UN81 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms