Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PADI4Q9UM07 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms