Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FOXD3Q9UJU5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FOXD3Q9UJU5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXD3Q9UJU5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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FOXD3Q9UJU5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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FOXD3Q9UJU5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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FOXD3Q9UJU5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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FOXD3Q9UJU5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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FOXD3Q9UJU5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FOXD3Q9UJU5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FOXD3Q9UJU5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FOXD3Q9UJU5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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