Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms