Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms