Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBJ2

ABCD2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD2Q9UBJ2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD2Q9UBJ2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms