Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPG2Q9UBF2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms