Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms