Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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RDH8Q9NYR8 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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RDH8Q9NYR8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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RDH8Q9NYR8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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RDH8Q9NYR8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
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