Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARVAQ9NVD7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms