Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms