Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms