Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4CQ9C0C4 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms